一、血清學研究室

• 口蹄疫及豬瘟血清學監測。
• 豬隻病毒性疾病之血清學檢測及分析。
• 豬隻病毒性疾病免疫建議及改善服務。
• 豬隻病毒性疾病免疫學研究。

二、病毒學研究室

• 豬隻病毒性疾病之診斷鑑定。
• 新浮現病毒病原性探討。
• 豬隻病毒性疾病流行病學探討、分析。

三、分子生物學研究室

• 應用分子生物技術協助豬隻病毒性疾病之診斷鑑定。
• 單源抗體及疫苗之研發。
• 動物用疾病檢測診斷試劑及技術之開發。

四、海外動物傳染病監控研究

• 海外動物傳染病檢測試劑引進及技術建立。
• 海外動物傳染病血清學監控。

五、GLP (good laboratory practice, 優良實驗室操作) 動物舍

• 負責本所豬隻疫苗效力、豬隻病毒病原性試驗。
• 接受所外合作或委託豬隻疫苗效力試驗。

六、TAF專區

91年10月通過豬瘟及口蹄疫中和抗體試驗ISO 17025實驗室初次認證 (認可編號：0855)。 95年3月通過TAF - ISO / IEC 17025 2005實驗室延展認證。 96年5月通過TAF - ISO / IEC 17025 2005實驗室監督評鑑。 97年6月通過TAF - ISO / IEC 17025 2005實驗室增項認證(豬假性狂犬病中和抗體試驗)。 98年7月通過TAF - ISO / IEC 17025 2005實驗室異動申請及延展認證，有效期間於98年07月09日至101年07月08日止。 99年12月通過TAF - ISO / IEC 17025 2005實驗室監督評鑑及異動申請認證。 101年7月通過TAF - ISO / IEC 17025 2005實驗室異動申請、增項認證及延展認證，包括口蹄疫中和抗體試驗、豬瘟抗體試驗、豬假性狂犬病中和抗體試驗、口蹄疫非結構蛋白抗體試驗等四項認證，有效期間於101年07月30日至104年07月29日止。 102年12月通過TAF - ISO / IEC 17025 2005實驗室異動申請及增項認證，包括口蹄疫病毒分離試驗、口蹄疫病毒反轉錄聚合酶鏈反應試驗、口蹄疫病毒酵素連結免疫吸附法試驗等三項認證，有效期間於101年07月30日至104年07月29日止。 103年4月通過TAF - ISO / IEC 17025 2005實驗室監督評鑑及異動申請認證。 104年6月15日通過TAF - ISO / IEC 17025 2005 延展認證評鑑，認可項目包括口蹄疫(O型)中和抗體試驗、豬瘟中和抗體試驗、豬假性狂犬病中和抗體試驗、口蹄疫非結構蛋白抗體試驗、口蹄疫病毒分離試驗、口蹄疫病毒反轉錄聚合酶鏈反應試驗、口蹄疫病毒酵素連結免疫吸附法試驗、豬瘟病毒分離試驗等八項，認證期間為104年10月5日至107年10月4日止。 105年12月23日通過TAF – ISO / IEC 17025 2005增列認證評鑑，認可項目包括口蹄疫(O型)中和抗體試驗、豬瘟中和抗體試驗、豬假性狂犬病中和抗體試驗、口蹄疫非結構蛋白抗體試驗、口蹄疫病毒分離試驗、口蹄疫病毒反轉錄聚合酶鏈反應試驗、口蹄疫病毒酵素連結免疫吸附法試驗、豬瘟病毒分離試驗、豬瘟病毒即時反轉錄聚合酶鏈反應試驗等九項，認證期間為104年10月5日至107年10月4日止。 106年12月通過實驗室監督評鑑、ILAC-MRA組合標記使用、實驗室主管及報告簽署人等異動認證。 107年2月通過實驗室主管異動認證。 107年6月通過報告簽署人異動認證。107年12月3日通過機關首長、實驗室主管、報告簽署人等異動認證。108年3月28日通過TAF – ISO / IEC 17025 2017延展及增列認證評鑑，認可項目包括口蹄疫(O型)中和抗體試驗、豬瘟中和抗體試驗、豬假性狂犬病中和抗體試驗、口蹄疫非結構蛋白抗體試驗、口蹄疫病毒分離試驗、口蹄疫病毒反轉錄聚合酶鏈反應試驗、口蹄疫病毒酵素連結免疫吸附法試驗、豬瘟病毒分離試驗、豬瘟病毒即時反轉錄聚合酶鏈反應試驗及非洲豬瘟病毒定量聚合酶鏈反應試驗等十項，認證期間為108年3月28日至111年3月27日止。 109年10月20日通過TAF - ISO / IEC 17025 2017監督及增列認證評鑑(口蹄疫病毒即時反轉錄聚合酶鏈反應試驗)。 實驗室主管:鄧明中 研究員兼組長。 報告簽署人:鄧明中 研究員兼組長、潘居祥 副研究員、張家宜 副研究員、黃有良 副究員、王群 助理研究員、蔡國榮 助理研究員、洪鈴柱 助理研究員、陳姿菡 助理研究員。 品質負責人：陳姿菡 助理研究員