設計理念：

臺灣島和V字結合，以負空間法展現臺灣島嶼外型在字中，直觀且簡約的方式展現來自臺灣的獸醫硏究所，讓整體表現出更好的文字識別性，而不過於複雜。色彩選擇青綠色和銘黃色，綠色與自然環境和生命力相關聯，表達了對自然生態系統的關懷以及對動物健康的承諾，銘黃色代表活力和生氣，彰顯機構對於動物健康和福祉的熱情和關懷，使整個標誌能夠代表獸醫硏究所的形象。

本所所徽使用色碼：

本所所徽