- 目前國內核准使用之犬貓疫苗大多是混合性疫苗，犬用疫苗種類有下列幾種：
- 犬瘟熱、傳染性肝炎、犬小病毒活毒混合疫苗
- 犬瘟熱、腺病毒第二型活毒、鉤端螺旋體不活化混合疫苗
- 犬瘟熱、腺病毒第二型、副流行性感冒、小病毒活毒混合疫苗
- 犬瘟熱、腺病毒第二型、副流行性感冒、小病毒活毒、鉤端螺旋體不活化混合疫苗
- 犬瘟熱、腺病毒第二型、副流行性感冒活毒、小病毒、冠狀病毒、鉤端螺旋體不活化混合疫苗
- 犬瘟熱、傳染性肝炎、腺病毒第二型、小病毒、副流行性感冒活毒、鉤端螺旋體、狂犬病不活化混合疫苗
- 犬博德氏菌、副流行性感冒病毒不活化混合疫苗
- 犬瘟熱、犬小病毒活毒混合疫苗
- 犬小病毒活毒疫苗
- 鉤端螺旋體症疫苗
- 犬副流行性感冒活毒疫苗
- 犬萊姆病不活化疫苗
- 皮黴菌不活化菌苗
- 犬梨形鞭毛蟲不活化疫苗
- 狂犬病不活化疫苗
- 貓用疫苗有下列幾種：
- 貓瘟、卡里西病、鼻氣管炎混合疫苗
- 貓瘟、卡里西病、鼻氣管炎、白血病混合疫苗
- 貓瘟、卡里西病、鼻氣管炎、鸚鵡披衣菌混合疫苗
- 貓瘟、卡里西病、鼻氣管炎、白血病、鸚鵡披衣菌混合疫苗
- 貓白血病不活化疫苗
- 貓傳染性腹膜炎疫苗
- 貓狂犬病基因改造活毒疫苗
單價疫苗在犬有犬小病毒活毒疫苗、鉤端螺旋體、犬副流行性感冒活毒疫苗、犬萊姆病、皮黴菌不活化菌苗、梨形鞭毛蟲不活化疫苗及狂犬病疫苗等；在貓有貓白血病疫苗、貓傳染性腹膜炎疫苗及貓狂犬病基因改造活毒疫苗三種。